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我校教師昝鄉(xiāng)鎮(zhèn)主持申報(bào)的項(xiàng)目《基于吸引域變化的基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的干預(yù)研究》獲浙江省自然科學(xué)基金一般項(xiàng)目立項(xiàng)。

基因組學(xué)研究的一個(gè)主要的目的就是如何有效地的干預(yù)系統(tǒng)，使得系統(tǒng)朝人們期望的方向演化。本研究直接從吸引域結(jié)構(gòu)的改變?nèi)胧郑芯炕蛘{(diào)控網(wǎng)絡(luò)結(jié)構(gòu)干預(yù)的方法和理論。我們主要開(kāi)展了以下幾方面的研究：（1）我們?cè)谥丿B基因降權(quán)（PADOG）方法基礎(chǔ)上提出了一種基于基因重要性和特異性的通路分析方法PAGIS。實(shí)驗(yàn)結(jié)果表明，PAGIS方法比PADOG能夠提高很多癌癥相關(guān)的排名，從而提高癌癥相關(guān)通路的識(shí)別效果。此外，我們將基因的重要性和特異性考慮到SPIA方法中并提出SPIA_IS方法。數(shù)據(jù)結(jié)果表明：我們提出的方法可以識(shí)別更多的癌癥相關(guān)通路；（2）2016年我們提出的基于狀態(tài)域的最優(yōu)干預(yù)算法可以明顯改進(jìn)算法的時(shí)間復(fù)雜度，但是該算法的加過(guò)程和減過(guò)程非常復(fù)雜。 我們提出了凈狀態(tài)域（netBOSs）的概念。根據(jù)受干擾狀態(tài)的先后順序，可以很簡(jiǎn)單的計(jì)算出其netBOSs，該方法不僅提高了時(shí)間效率，也簡(jiǎn)化了計(jì)算過(guò)程。（3）我們提出了一種名為miR_SubPath的新方法，通過(guò)三個(gè)步驟來(lái)鑒定疾病相關(guān)的miRNA。數(shù)據(jù)結(jié)果顯示，所提出的miR_SubPath方法比先前的方法更強(qiáng)健并且可以鑒定更多的疾病相關(guān)的miRNA。（4）基于基因調(diào)控網(wǎng)絡(luò)的研究成果，我們將其應(yīng)用到綜合航電系統(tǒng)安全性分析領(lǐng)域，提出的一種有效的算法可以快速預(yù)測(cè)系統(tǒng)安全是否發(fā)生故障，以及發(fā)生故障的條件下如何通過(guò)有效的干預(yù)，使得系統(tǒng)盡快恢復(fù)到期望的安全狀態(tài)。